Animalscaretips
Microarray-analyysi sisältää solun avaamisen, sen geneettisen sisällön eristämisen, kaikkien kyseisessä solussa päällä olevien geenien tunnistamisen ja luettelon luomisen näistä geeneistä. DNA-mikrosiruanalyysi on tekniikka, jota tutkijat käyttävät määrittääkseen, ovatko geenit päällä vai pois päältä.
- Mihin microarray-analyysiä käytetään?
- Miksi tiedemiehet käyttävät mikrosirua?
- Kuinka microarray-analyysiä käytetään nykyään??
- Mitä microarray-analyysi voi havaita?
- Mikä on mikrosiru bioinformatiikassa?
- Mikä on eksoniloukun tarkoitus?
- Mitkä ovat microarray-sovellukset?
- Mikä on DNA-mikrosirujen merkitys?
- Kuinka tutkijat määrittävät organismin geneettisen sekvenssin?
- Miten mikrosiru toimii ja miten sitä käytetään?
- Mitä seuraavista tekniikoista käytetään mikrosirujen valmistukseen?
- Mitä työkaluja käytetään mikrosiruanalyysiin?
- Mikä on microarray-tekniikka?
- Kuinka tarkka on microarray-testaus?
- Mitä CMA voi havaita?
Mihin microarray-analyysiä käytetään?
Mikrosiru on laboratoriotyökalu, jota käytetään tuhansien geenien ilmentymisen havaitsemiseen samanaikaisesti. DNA-mikrosirut ovat mikroskoopin objektilaseja, joihin on painettu tuhansia pieniä täpliä määritellyissä kohdissa, ja jokainen täplä sisältää tunnetun DNA-sekvenssin tai geenin.
Miksi tiedemiehet käyttävät mikrosirua?
Itse asiassa microarray-analyysi antaa tutkijoille mahdollisuuden tarkastella ilmentymismalleja koko genomin kaikissa geeneissä – ja tehdä se yhdessä menettelyssä. Tämän seurauksena on nyt mahdollista seurata kymmenien tuhansien geenien toimintaa samanaikaisesti.
Kuinka microarray-analyysiä käytetään nykyään??
Nykyään DNA-mikrosiruja käytetään joidenkin sairauksien kliinisissä diagnostisissa testeissä. ... Mikrosirujen avulla voidaan myös tutkia, missä määrin tietyt geenit kytkeytyvät päälle tai pois päältä soluissa ja kudoksissa. Tässä tapauksessa DNA:n eristämisen sijaan näytteistä eristetään ja mitataan RNA (joka on DNA:n transkriptio).
Mitä microarray-analyysi voi havaita?
Mitä kromosomaalinen mikrosiru havaitsee? CMA (Chromosomal microarray) -testaus etsii ylimääräisiä (kaksoistettuja) tai puuttuvia (poistettuja) kromosomisegmenttejä, joita joskus kutsutaan kopionumerovariantteiksi (CNV).
Mikä on mikrosiru bioinformatiikassa?
"Mikrosiru" on lasista valmistettu laboratoriolasi, jonka pinnalla on tuhansia pieniä huokosia määrätyissä kohdissa. Se toimii komplementaaristen DNA-säikeiden hybridisaatioperiaatteen mukaisesti ja antaa meille mahdollisuuden analysoida useiden geenien ilmentymiä yhdessä reaktiossa tehokkaasti.
Mikä on eksoniloukun tarkoitus?
Eksoniloukku on molekyylibiologian tekniikka potentiaalisten eksonien tunnistamiseksi eukaryootin DNA-fragmentista, jolla on tuntematon introni-eksonirakenne. Tämä tehdään sen määrittämiseksi, onko fragmentti osa ilmennettyä geeniä.
Mitkä ovat microarray-sovellukset?
Nykyinen mikrosirusovellusten laajuus sisältää sekvensoinnin hybridisaatiolla, uudelleensekvensoinnin, mutaatioiden havaitsemisen, geenin kopioluvun arvioinnin, vertailevan genomin hybridisoinnin, lääkkeiden löytämisen, ilmentymisanalyysin ja immunomäärityksen (proteiinimikrosirut).
Mikä on DNA-mikrosirujen merkitys?
DNA-mikrosiru on tehokas työkalu transkriptomiikassa, joka auttaa meitä tutkimaan ja analysoimaan lähes jokaisen organismissa esiintyvän geenin mRNA-ilmentymistä. Mikro-organismien koko genomin sekvensoinnin ansiosta on nyt mahdollista tunnistaa geenit, joilla on potentiaalia bioremediaatioon.
Kuinka tutkijat määrittävät organismin geneettisen sekvenssin?
Nämä kirjaimet ja värit edustavat DNA-koodia – kemikaaleja, jotka muodostavat geneettisen suunnitelmamme säikeen. Tiedemiehet voivat ottaa näytteitä organismeista vanupuikolla ja "lukea" niiden DNA:ta DNA-sekvensointiprosessin kautta.
Miten mikrosiru toimii ja miten sitä käytetään?
Mikrosirujen taustalla oleva periaate on, että komplementaariset sekvenssit sitoutuvat toisiinsa. Tuntemattomat DNA-molekyylit leikataan fragmenteiksi restriktioendonukleaasien avulla; fluoresoivat markkerit on kiinnitetty näihin DNA-fragmentteihin. Niiden annetaan sitten reagoida DNA-sirun koettimien kanssa.
Mitä seuraavista tekniikoista käytetään mikrosirujen valmistukseen?
Mikrosiruja voidaan valmistaa useilla eri tekniikoilla, mukaan lukien painaminen hienokärkisellä nastalla lasilevyille, valolitografia käyttämällä valmiita maskeja, fotolitografia dynaamisilla mikropeililaitteilla, mustesuihkutulostus tai sähkökemia mikroelektrodiryhmille.
Mitä työkaluja käytetään mikrosiruanalyysiin?
Vain kolme työkalua pystyy käsittelemään kaikentyyppisiä klassisia mikrosiruja, nimittäin ArrayExpress ja NCBI GEO varastointiin ja Bioconductor analysointiin.
Mikä on microarray-tekniikka?
Microarray-tekniikka on kehittyvä tekniikka, jota käytetään useiden geenien ilmentymisen tutkimiseen kerralla. Se sisältää tuhansien geenisekvenssien sijoittamisen tunnettuihin paikkoihin lasilevylle, jota kutsutaan geenisiruksi. DNA:ta tai RNA:ta sisältävä näyte asetetaan kosketuksiin geenisirun kanssa.
Kuinka tarkka on microarray-testaus?
CMA tunnistaa 100 % tarkasti prenataalisten näytteiden yleiset aneuploidiat verrattuna karyotyyppiin (2, 16, 17), ja NICHD-tutkimuksessa se osoitti paremman diagnostisen tuoton verrattuna tavalliseen karyotyyppiin 1.7 % potilaista, jotka lähetettiin pitkälle edenneeseen äidin, vanhempien ahdistuneisuuden ja positiiviseen seerumitutkimukseen (2).
Mitä CMA voi havaita?
Prenataalinen CMA vertaa syntymättömän vauvan DNA:n tiettyjä alueita normaalin genomin alueisiin. CMA voi havaita kromosomaaliset kaksoiskappaleet tai deleetiot – paikat, joissa on ylimääräisiä tai puuttuvia DNA:n paloja – joita ei havaita tavallisella karyotyyppitestillä.
